Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AP002495.1-202ENST00000528511 933 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC007610.3-201ENST00000566879 934 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PROCR-201ENST00000216968 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 GCNT7-202ENST00000617620 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 OR6B2-201ENST00000402971 1492 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 CDYLP1-201ENST00000419017 1458 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms