Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB38P57729 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB38P57729 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB38P57729 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms