Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APODP05090 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APODP05090 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APODP05090 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APODP05090 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APODP05090 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APODP05090 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APODP05090 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APODP05090 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APODP05090 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms