Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC144AA2RUR9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms