Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms