Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM55Q9BYV6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms