Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGSF1Q8N6C5 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms