Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF550Q7Z398 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZNF550Q7Z398 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms