Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
UPP1Q16831 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPP1Q16831 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms