Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDK4Q16654 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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