Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TCIRG1Q13488 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TCIRG1Q13488 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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