Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms