Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms