Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2C1P98194 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms