Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRMUO75648 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRMUO75648 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMUO75648 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMUO75648 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMUO75648 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMUO75648 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMUO75648 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMUO75648 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMUO75648 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMUO75648 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMUO75648 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMUO75648 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRMUO75648 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms