Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms