Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00312Q9Y6C7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms