Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms