Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL42Q9P2K6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms