Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD5Q9P267 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD5Q9P267 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms