Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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PKP4Q99569 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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PKP4Q99569 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PKP4Q99569 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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