Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB3IPQ96QF0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB3IPQ96QF0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms