Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms