Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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NCF4Q15080 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NCF4Q15080 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NCF4Q15080 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NCF4Q15080 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NCF4Q15080 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NCF4Q15080 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NCF4Q15080 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NCF4Q15080 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms