Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A3Q14050 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A3Q14050 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms