Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SKP2Q13309 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms