Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSRP1Q08945 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms