Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACVR1Q04771 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms