Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms