Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTUD4Q01804 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms