Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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PTPRAP18433 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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