Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BMP3P12645 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BMP3P12645 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BMP3P12645 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BMP3P12645 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms