Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP1B1P05026 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms