Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIOO75962 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIOO75962 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIOO75962 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIOO75962 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms