Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E9PCH4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E9PCH4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
E9PCH4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E9PCH4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E9PCH4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E9PCH4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E9PCH4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E9PCH4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E9PCH4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E9PCH4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
E9PCH4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms