Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hmg20bQ9Z104 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hmg20bQ9Z104 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hmg20bQ9Z104 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms