Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Srd5a3Q9WUP4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Srd5a3Q9WUP4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Srd5a3Q9WUP4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Srd5a3Q9WUP4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms