Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Upk3aQ9JKX8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Upk3aQ9JKX8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Upk3aQ9JKX8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Upk3aQ9JKX8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Upk3aQ9JKX8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Upk3aQ9JKX8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Upk3aQ9JKX8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Upk3aQ9JKX8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Upk3aQ9JKX8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms