Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap4m1Q9JKC7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap4m1Q9JKC7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ap4m1Q9JKC7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms