Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Derl1Q99J56 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Derl1Q99J56 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Derl1Q99J56 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Derl1Q99J56 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Derl1Q99J56 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Derl1Q99J56 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Derl1Q99J56 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Derl1Q99J56 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Derl1Q99J56 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Derl1Q99J56 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Derl1Q99J56 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Derl1Q99J56 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Derl1Q99J56 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Derl1Q99J56 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Derl1Q99J56 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Derl1Q99J56 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Derl1Q99J56 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Derl1Q99J56 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms