Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm9955Q8CEJ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm9955Q8CEJ8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Gm9955Q8CEJ8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm9955Q8CEJ8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm9955Q8CEJ8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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