Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG41

Psmb11, Proteasome subunit beta type-11, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb11Q8BG41 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb11Q8BG41 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb11Q8BG41 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb11Q8BG41 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb11Q8BG41 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb11Q8BG41 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb11Q8BG41 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms