Protein–RNA interactions for Protein: Q6W9L1

H2-M2, Histocompatibility 2, M region locus 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M2Q6W9L1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M2Q6W9L1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M2Q6W9L1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M2Q6W9L1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M2Q6W9L1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M2Q6W9L1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
H2-M2Q6W9L1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M2Q6W9L1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms