Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ckap2Q3V1H1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ckap2Q3V1H1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ckap2Q3V1H1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ckap2Q3V1H1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms