Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cep63Q3UPP8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cep63Q3UPP8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cep63Q3UPP8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms