Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc17a7Q3TXX4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc17a7Q3TXX4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc17a7Q3TXX4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms