Protein–RNA interactions for Protein: Q17RY0

CPEB4, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4Q17RY0 TARDBP-222ENST00000620505 657 ntTSL 57.83□□□□□ -1.167e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 TYMS-205ENST00000581920 886 ntTSL 56.87□□□□□ -1.317e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 TARDBP-209ENST00000480464 790 ntTSL 25.89□□□□□ -1.477e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 TARDBP-214ENST00000613177 379 ntTSL 35.42□□□□□ -1.547e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 TARDBP-212ENST00000611008 929 ntTSL 54.68□□□□□ -1.667e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 TARDBP-208ENST00000477447 409 ntTSL 54.53□□□□□ -1.687e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 AL109811.4-203ENST00000612542 554 ntAPPRIS P1 TSL 54.53□□□□□ -1.687e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 AL109811.4-202ENST00000611136 700 ntTSL 53.98□□□□□ -1.777e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 AL109811.4-204ENST00000622108 645 ntTSL 53.86□□□□□ -1.797e-8■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 LMNB2-205ENST00000532465 769 ntTSL 316.91■□□□□ 0.32e-22■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 LMNB2-202ENST00000475819 885 ntTSL 515.46■□□□□ 0.072e-22■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-22■□□□□ 8.3
CPEB4Q17RY0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-13■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-13■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.734e-6■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 ANP32A-207ENST00000486054 2015 ntTSL 215.33■□□□□ 0.044e-6■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 METAP2-211ENST00000553151 564 ntTSL 515.25■□□□□ 0.035e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.14e-6■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 METAP2-203ENST00000535095 2431 ntTSL 214.27□□□□□ -0.135e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 SLC2A1-208ENST00000630287 2398 ntTSL 514.03□□□□□ -0.165e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.214e-6■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 ANP32A-201ENST00000267918 1084 ntTSL 313.64□□□□□ -0.234e-6■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 513.47□□□□□ -0.254e-6■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.315e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 METAP2-209ENST00000550777 1779 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.555e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 METAP2-201ENST00000261220 1836 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.595e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.685e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 MFN2-201ENST00000235329 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.714e-6■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 METAP2-210ENST00000551840 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.895e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.085e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 ANP32A-206ENST00000483551 3711 ntTSL 58.01□□□□□ -1.134e-6■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 METAP2-206ENST00000549136 388 ntTSL 27.15□□□□□ -1.265e-11■□□□□ 8.2
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CPEB4Q17RY0 METAP2-207ENST00000549502 513 ntTSL 46.29□□□□□ -1.45e-11■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 LUC7L3-203ENST00000503728 783 ntTSL 56.13□□□□□ -1.437e-7■□□□□ 8.2
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CPEB4Q17RY0 LUC7L3-216ENST00000509487 647 ntTSL 34.71□□□□□ -1.667e-7■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 LUC7L3-222ENST00000513969 419 ntTSL 32.47□□□□□ -2.017e-7■□□□□ 8.2
CPEB4Q17RY0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.652e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 SPN-205ENST00000563039 1853 ntTSL 517.83■□□□□ 0.442e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.12e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.292e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 HNRNPH3-208ENST00000481819 2704 ntTSL 1 (best)11.87□□□□□ -0.512e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 HNRNPH3-207ENST00000480987 752 ntTSL 411.23□□□□□ -0.612e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 SEC24C-203ENST00000465076 4668 ntTSL 1 (best)10.09□□□□□ -0.792e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 SEC24C-201ENST00000339365 4513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.832e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 HNRNPH3-205ENST00000469172 3356 ntTSL 29.36□□□□□ -0.912e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 SEC24C-202ENST00000345254 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.072e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 HNRNPH3-203ENST00000461310 648 ntTSL 57.52□□□□□ -1.212e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 HNRNPH3-204ENST00000467249 566 ntTSL 26.63□□□□□ -1.352e-6■□□□□ 8.1
CPEB4Q17RY0 HNRNPH3-209ENST00000486854 635 ntTSL 25.59□□□□□ -1.512e-6■□□□□ 8.1
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