Protein–RNA interactions for Protein: Q04304

YMR090W, UPF0659 protein YMR090W, yeast

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR090W	Q04304	SSK22	YCR073C	3996 nt		4.8	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	CLP1	YOR250C	1338 nt		4.8	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	HEM3	YDL205C	984 nt		4.8	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	HVG1	YER039C	750 nt		4.8	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	YHR213W-A	YHR213W-A	234 nt		4.8	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	YHR218W-A	YHR218W-A	318 nt		4.8	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	PSH1	YOL054W	1221 nt		4.8	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	YBL112C	YBL112C	318 nt		4.8	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	YIR007W	YIR007W	2295 nt		4.8	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	VRP1	YLR337C	2454 nt		4.8	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	EHD3	YDR036C	1503 nt		4.79	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	AIM20	YIL158W	615 nt		4.79	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	SFC1	YJR095W	969 nt		4.79	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	RFA1	YAR007C	1866 nt		4.79	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	PAB1	YER165W	1734 nt		4.78	□□□□□ -1.64
YMR090W	Q04304	FAT3	YKL187C	2253 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	YME1	YPR024W	2244 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	UTP4	YDR324C	2331 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	YEL077C	YEL077C	3834 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	YER010C	YER010C	705 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	YKL031W	YKL031W	414 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	SCS22	YBL091C-A	528 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	YPR098C	YPR098C	486 nt		4.77	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	ROG3	YFR022W	2202 nt		4.76	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	RPS5	YJR123W	678 nt		4.76	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	YLR296W	YLR296W	327 nt		4.76	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	MRPL10	YNL284C	969 nt		4.76	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	HAP1	YLR256W	4509 nt		4.76	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	AMD1	YML035C	2433 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	PRI2	YKL045W	1587 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	SEC12	YNR026C	1416 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	UGX2	YDL169C	672 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	SEC20	YDR498C	1152 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	SRY1	YKL218C	981 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	CIN4	YMR138W	576 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	VBA1	YMR088C	1689 nt		4.75	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	MNN2	YBR015C	1794 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	ATO3	YDR384C	828 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	HCR1	YLR192C	798 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	UBC11	YOR339C	471 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	EMW1	YNL313C	2715 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	VTC2	YFL004W	2487 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	ASN1	YPR145W	1719 nt		4.74	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	STL1	YDR536W	1710 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	YDR053W	YDR053W	396 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	COX20	YDR231C	618 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	YHL018W	YHL018W	363 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	PGA2	YNL149C	390 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	YBR144C	YBR144C	315 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	MRPS5	YBR251W	924 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	GPT2	YKR067W	2232 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	PAP2	YOL115W	1755 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	SNT2	YGL131C	4212 nt		4.73	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	AAP1	YHR047C	2571 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	GLE1	YDL207W	1617 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	YAP1801	YHR161C	1914 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	HPF1	YOL155C	2904 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	YJR154W	YJR154W	1041 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	IDP3	YNL009W	1263 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	GDA1	YEL042W	1557 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	RIM15	YFL033C	5313 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	CST6	YIL036W	1764 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	DBP9	YLR276C	1785 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	ABZ1	YNR033W	2364 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	GUP2	YPL189W	1830 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	BAP2	YBR068C	1830 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	DSF1	YEL070W	1509 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	YNR073C	YNR073C	1509 nt		4.72	□□□□□ -1.65
YMR090W	Q04304	YKR023W	YKR023W	1593 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	YJL171C	YJL171C	1191 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	DRE2	YKR071C	1047 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	ERI1	YPL096C-A	207 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	ECM3	YOR092W	1842 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	RNR3	YIL066C	2610 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	SIA1	YOR137C	1869 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	OXP1	YKL215C	3861 nt		4.71	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	UTP18	YJL069C	1785 nt		4.7	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	PDC1	YLR044C	1692 nt		4.7	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	ASF2	YDL197C	1578 nt		4.7	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	PDH1	YPR002W	1551 nt		4.7	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	RGT1	YKL038W	3513 nt		4.7	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	GDB1	YPR184W	4611 nt		4.7	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	CDC43	YGL155W	1131 nt		4.7	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	APS3	YJL024C	585 nt		4.7	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	GCV3	YAL044C	513 nt		4.7	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	QRI5	YLR204W	336 nt		4.7	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	ODC2	YOR222W	924 nt		4.7	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	RDL2	YOR286W	450 nt		4.7	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	RPS9A	YPL081W	594 nt		4.7	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	SUE1	YPR151C	621 nt		4.7	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	YPR160C-A	YPR160C-A	285 nt		4.7	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	FLC3	YGL139W	2409 nt		4.7	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	RRP9	YPR137W	1722 nt		4.69	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	BUL1	YMR275C	2931 nt		4.69	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	GLO2	YDR272W	825 nt		4.69	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	YML012C-A	YML012C-A	378 nt		4.69	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	RPS15	YOL040C	429 nt		4.69	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	SET5	YHR207C	1581 nt		4.69	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	UBA1	YKL210W	3075 nt		4.69	□□□□□ -1.66
YMR090W	Q04304	GLT1	YDL171C	6438 nt		4.69	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.4 ms