Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ifna9P09235 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifna9P09235 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ifna9P09235 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms