Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01658 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01658 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01658 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01658 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
P01658 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01658 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01658 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01658 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
P01658 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P01658 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01658 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01658 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01658 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01658 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01658 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01658 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01658 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01658 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01658 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
P01658 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01658 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01658 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01658 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01658 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01658 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01658 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01658 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01658 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01658 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01658 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01658 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01658 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01658 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01658 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01658 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01658 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01658 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01658 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01658 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01658 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01658 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01658 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01658 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01658 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01658 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01658 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01658 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01658 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01658 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01658 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01658 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01658 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01658 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01658 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
P01658 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01658 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01658 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01658 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
P01658 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01658 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01658 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01658 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01658 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01658 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01658 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01658 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01658 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01658 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01658 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01658 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01658 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01658 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01658 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01658 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01658 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01658 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01658 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01658 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01658 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01658 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01658 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01658 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01658 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01658 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01658 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01658 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
P01658 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01658 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01658 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
P01658 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01658 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01658 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01658 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01658 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01658 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01658 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01658 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01658 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01658 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms